Hur man beräknar Sequence Täckning

Anriknings studier kräver beräkning av sekvensdata för att bestämma nivån på täckning. Detta görs i första hand med gen sekvenselaboratoriersom kräver integrerad förberedelse DNA-prov och pre - anrikning pooling . Beräkning sekvensetäckningkräver användning variabler som inkluderar medelsekvensetäckning, den totala riktade baser och verkningsgraden anrikning . Utföra denna beräkning görs genom att mata in alla dessa variabler i en ekvation . Instruktioner
1

Skriv ut ekvationen som används för att beräkna medelvärdet sekvense täckning. Detta kommer att se ut den önskade täckningen dividerat med genomsnitt normaliserad täckning. Om den önskade täckningen är 10x och den genomsnittliga normaliserade täckningen är 0,2 , då den genomsnittliga sekvense täckningen är 50. köpa 2

Skriv ut ekvationen som används för att beräkna mängden sekvensering. Detta kommer att se ut ( totalt riktade baser ) (medel sekvensetäckning) /( verkningsgrad anrikning ) = mängden sekvensering.
3

Koppla in 62 MB för " total riktade baser " och 0,65 för den " berikning effektivitet. " Lägg sekvense täckning belopp på 50x och ekvationen kommer att se ut (62) (50) /0.65 . Resultatet av ekvationen blir 4,8 GB sekvenseringsdata . Addera